Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms