Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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LINC00587B1AMM8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LINC00587B1AMM8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LINC00587B1AMM8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LINC00587B1AMM8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LINC00587B1AMM8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00587B1AMM8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00587B1AMM8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00587B1AMM8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00587B1AMM8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00587B1AMM8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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