Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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