Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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USP31Q70CQ4 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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USP31Q70CQ4 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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USP31Q70CQ4 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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USP31Q70CQ4 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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USP31Q70CQ4 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP31Q70CQ4 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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