Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LAMA3Q16787 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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