Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CTF1Q16619 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms