Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms