Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TAF1AQ15573 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TAF1AQ15573 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms