Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PUM3Q15397 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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