Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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