Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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TOP3AQ13472 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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