Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms