Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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TRAF1Q13077 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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TRAF1Q13077 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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TRAF1Q13077 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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TRAF1Q13077 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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