Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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