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| FOXF2 | Q12947 | RN7SKP115-201 | ENST00000363177 | 317 nt | BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-839P-201 | ENST00000363347 | 108 nt | BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNA5SP223-201 | ENST00000365174 | 120 nt | BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CCNB3-203 | ENST00000376038 | 1201 nt | TSL 5 BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AC012409.2-201 | ENST00000619812 | 751 nt | TSL 5 BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | SMIM18-202 | ENST00000626298 | 114 nt | TSL 5 BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | LINC01090-203 | ENST00000632331 | 466 nt | TSL 5 BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | LIMA1-212 | ENST00000552491 | 2652 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ARHGEF6-203 | ENST00000370622 | 4779 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ARID2-202 | ENST00000422737 | 5481 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | FAM216B-201 | ENST00000313851 | 3243 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ASPN-201 | ENST00000375543 | 2237 nt | TSL 2 BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ZNF630-207 | ENST00000616492 | 2220 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | PATE1-201 | ENST00000305738 | 1527 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ZFP14-201 | ENST00000270001 | 7489 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | NR2C2-213 | ENST00000617312 | 8113 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | LINC00507-201 | ENST00000540882 | 1935 nt | TSL 5 BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ATRX-201 | ENST00000373344 | 11220 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CFHR4-204 | ENST00000608469 | 1601 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RAB18-209 | ENST00000621805 | 4894 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SPAM1-201 | ENST00000223028 | 2007 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC125336.1-201 | ENST00000508893 | 2827 nt | BASIC | 4.5 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SENP7-204 | ENST00000394085 | 1483 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ZBTB8A-202 | ENST00000373510 | 7075 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC090826.1-202 | ENST00000562009 | 3337 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | PAK3-213 | ENST00000620137 | 2130 nt | TSL 5 BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AL022311.1-201 | ENST00000623726 | 19416 nt | BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SMNDC1-202 | ENST00000369603 | 4341 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ATP1B4-202 | ENST00000361319 | 3856 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ZNF569-203 | ENST00000392150 | 1918 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | RRM2B-203 | ENST00000395912 | 900 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MFAP5-202 | ENST00000396549 | 1195 nt | TSL 2 BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AC009411.1-202 | ENST00000412424 | 548 nt | TSL 4 BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC092647.1-201 | ENST00000420654 | 287 nt | BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | OFD1P12Y-201 | ENST00000427963 | 1207 nt | BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | NPM1P24-201 | ENST00000428039 | 894 nt | BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | UBE2V1P5-201 | ENST00000440070 | 405 nt | BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AC112498.1-201 | ENST00000444401 | 332 nt | BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RPL7P36-201 | ENST00000444633 | 681 nt | BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | IGHV5-78-201 | ENST00000450948 | 295 nt | BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AL137802.1-201 | ENST00000452795 | 327 nt | TSL 5 BASIC | 4.49 | □□□□□ -1.69 | | |