Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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