Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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