Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms