Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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