Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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RFXAPO00287 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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RFXAPO00287 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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RFXAPO00287 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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RFXAPO00287 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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RFXAPO00287 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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