Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms