Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP18Q9UMW8 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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