Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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DTX3Q8N9I9 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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