Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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COL24A1Q17RW2 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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COL24A1Q17RW2 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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COL24A1Q17RW2 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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COL24A1Q17RW2 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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COL24A1Q17RW2 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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COL24A1Q17RW2 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL24A1Q17RW2 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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COL24A1Q17RW2 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL24A1Q17RW2 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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COL24A1Q17RW2 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL24A1Q17RW2 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL24A1Q17RW2 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL24A1Q17RW2 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL24A1Q17RW2 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL24A1Q17RW2 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL24A1Q17RW2 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL24A1Q17RW2 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL24A1Q17RW2 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL24A1Q17RW2 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL24A1Q17RW2 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL24A1Q17RW2 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL24A1Q17RW2 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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