Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTL8BQ17RB0 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms