Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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