Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms