Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms