Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms