Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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