Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAX2Q9UIW0 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms