Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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