Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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