Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HS1BP3-202ENST00000402541 4358 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SPRYD3-204ENST00000547837 1655 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LRAT-201ENST00000336356 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DUSP27-202ENST00000361200 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4ENIF1-201ENST00000330125 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NFE2L1-202ENST00000361665 4729 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HIPK2-203ENST00000428878 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TOGARAM1-201ENST00000361462 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FGD3-202ENST00000375482 3321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM107B-206ENST00000378470 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DEF8-229ENST00000617948 3883 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GAS7-201ENST00000323816 8033 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXJ2-202ENST00000428177 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF608-201ENST00000306315 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ICOSLG-204ENST00000407780 7080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FOSB-202ENST00000417353 3667 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TCTN2-201ENST00000303372 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TUFT1-204ENST00000392712 2946 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025283.2-203ENST00000618352 2905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0319L-202ENST00000373266 2377 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ADCY5-201ENST00000309879 2841 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP8-219ENST00000514067 2829 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CST4-201ENST00000217423 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP20-1-201ENST00000334664 275 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA5C-201ENST00000364902 137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 C22orf15-202ENST00000382821 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PGAM1P7-201ENST00000413837 737 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL606490.3-201ENST00000422410 270 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOVL7-201ENST00000425382 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL807761.3-201ENST00000427833 329 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL13AP6-201ENST00000430133 612 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IDI2-AS1-203ENST00000434470 435 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL118511.2-201ENST00000436739 311 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RUSC1-AS1-201ENST00000443642 679 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CD79A-202ENST00000444740 567 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011452.1-201ENST00000451973 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031847.1-201ENST00000455744 378 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL60P-201ENST00000476209 299 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL397P-201ENST00000487309 298 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD51-AS1-202ENST00000526635 419 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SNHG14-211ENST00000547292 626 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IL32-225ENST00000548246 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025031.2-201ENST00000550319 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3911-201ENST00000577791 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AURKB-204ENST00000578549 939 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3943-201ENST00000585069 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC060766.2-201ENST00000588235 334 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IGFL1P1-201ENST00000599950 360 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL035425.1-201ENST00000608811 551 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2D-29-202ENST00000612356 310 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005702.5-201ENST00000618000 421 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H4L-201ENST00000618305 312 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025048.5-201ENST00000618795 421 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TPRXL-213ENST00000636198 651 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS13-207ENST00000528626 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068473.3-202ENST00000589723 4167 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0319-202ENST00000430948 6620 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ITIH2-201ENST00000358415 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.3 ms