Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC093392.1-201ENST00000366280 340 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MAGEB6P1-201ENST00000416929 1224 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CFL1P8-201ENST00000436148 475 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL049820.1-201ENST00000442936 423 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 OR11Q1P-201ENST00000451582 877 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RN7SL55P-201ENST00000464534 297 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 IGKV1-39-201ENST00000498574 398 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC090568.2-203ENST00000521433 579 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 GZMB-205ENST00000526004 819 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PRPSAP2-217ENST00000542013 1047 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC004224.2-201ENST00000574423 529 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC087645.1-201ENST00000588528 291 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF611-214ENST00000600943 560 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL136967.1-201ENST00000625120 441 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MIR6511B2-201ENST00000636908 71 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC01620-205ENST00000637248 546 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC106774.10-201ENST00000638486 599 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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