Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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