Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SS18Q15532 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SS18Q15532 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SS18Q15532 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms