Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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