Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF2H3Q13889 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms