Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms