Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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