Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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