Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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GRIK2Q13002 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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GRIK2Q13002 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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