Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPREP23469 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPREP23469 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPREP23469 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPREP23469 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPREP23469 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPREP23469 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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