Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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