Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRBP23467 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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