Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LRRTM2O43300 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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