Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP1Q9Y3L3 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms