Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms