Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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