Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL24A1Q17RW2 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms